2021-07-26

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微生物多样性QIIME2流程
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利用dada2/deblur降噪方法对16S/18S/ITS/功能基因等特定区段的高通量明升88序列进行错误校正，获得每个样本的ASV代表序列及丰度表，基于序列降噪结果进行微生物多样性分析，挖掘高通量明升88样本中微生物群落结构、进化关系以及微生物与理化指标相互作用等信息
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宏基因组云分析
宏基因组云分析
基于二代明升88平台，以特定生境中的整个微生物群落作为研究对象，解读微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络，探索微生物相互协作及与环境和宿主之间的关系等信息。
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真核有参转录组云分析
真核有参转录组云分析
根据真核生物参考基因组，针对高通量明升88数据进行表达量计算，获得基因表达差异及差异基因功能富集等信息，定量描述RNA世界，探索基因表达奥秘。
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全转录组云分析
全转录组云分析
指特定组织或细胞在特定状态下转录出的所有转录本信息的总和，基于二代明升88平台，采用去核糖体链特异性和小片段富集筛选的建库方法，实现编码RNA和非编码RNA（miRNA, lncRNA, circRNA）的建库、明升88、生物信息学分析及联合分析、ceRNA调控网络等，研究基因表达变化的同时分析非编码RNA对其调控作用，深入挖掘解读生命现象背后的转录与调控问题。
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iTRAQ/TMT蛋白组云分析
iTRAQ/TMT蛋白组云分析
TMT iTRAQ相对定量蛋白质组学云分析流程，根据高精质谱仪数据分析结果对蛋白质进行表达量计算，获得蛋白表达差异及差异蛋白功能富集等信息，定量描述蛋白世界，探索蛋白世界的多彩奥秘。
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代谢组云分析
代谢组云分析
通过液质联用（LC–MS）或气质联用（GC-MS）方法检测生物体受扰动或刺激前后大量代谢产物的动态变化，通过统计学和生物信息学分析，挖掘差异表达的代谢物，进而阐明生物体代谢相关过程的非靶向代谢组学技术。
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smallRNA云流程
smallRNA云流程
SmallRNA（小分子RNA）是一类长度在20-30nt 的RNA分子，主要包括miRNA、siRNA和piRNA。其在细胞的生长、发育、代谢等基础生物学过程中扮演着重要的角色。高通量明升88技术可以一次性产生上百万条smallRNA序列，能够快速鉴定特定条件下表达的smallRNA并发现新的smallRNA，并进行不同条件下smallRNA的表达差异以及其靶基因分析等。
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Binning云分析
Binning云分析
在宏基因组分析中，根据一定的特征，将来自不同个体的序列（reads或contigs）分离开来的过程即为binning。使用宏基因组拼接组装获得的contigs进行binning组装，并通过质量评估和筛选，获得高质量的bins，可以对指定的Bin进行基因组组装，并在基因组层面进行分析。
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真核无参转录组云分析
真核无参转录组云分析
无需物种基因组信息，以新一代高通量转录组明升88数据作为输入，通过从头(de novo)组装构建转录组，然后对获得的转录组序列，进行功能注释、表达定量、表达差异以及结构分析等，借助转录组明升88之力探秘无参物种。
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原核转录组云分析
原核转录组云分析
从RNA水平研究基因表达的情况，通过细菌转录组比较分析，研究细菌在不同环境、宿主等情况下的基因表达变化，从而阐述宿主、环境对细菌的影响、细菌致病机制等。还可以深入挖掘sRNA和基因结构的信息，进一步为基因网络调控的研究提供有力支持。
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lncRNA云分析
lncRNA云分析
lncRNA是一类长度大于200nt的非编码RNA，广泛存在于各种生物体内，能够在表观遗传、转录以及转录后等各种水平上对生命活动进行关键性的调控。lncRNA明升88是通过高通量明升88技术及生物信息学方法在整体水平上解释样品中lncRNA及mRNA全面信息的研究方法。
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微生物多样性云分析
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基于二代明升88平台，对16S rDNA/18S rDNA/ITS/功能基因等特定区段PCR产物进行高通量明升88，探究环境样本中的微生物群落结构、进化关系以及微生物与环境相关性等信息。
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